Instrumenter CPython avec DTrace et SystemTap¶

auteur: David Malcolm
auteur: Łukasz Langa

DTrace et SystemTap sont des outils de surveillance, chacun fournissant un moyen de d’inspecter ce que font les processus d’un système informatique. Ils utilisent tous les deux des langages dédiés permettant à un utilisateur d’écrire des scripts qui permettent de :

Filtrer les processus à observer.

Recueillir des données sur le processus choisi.

Générer des rapports sur les données.

À partir de Python 3.6, CPython peut être compilé avec des « marqueurs » intégrés, aussi appelés « sondes », qui peuvent être observés par un script DTrace ou SystemTap, ce qui facilite le suivi des processus CPython.

CPython implementation detail: Les marqueurs DTrace sont des détails d’implémentation de l’interpréteur CPython. Aucune garantie n’est donnée quant à la compatibilité des sondes entre les versions de CPython. Les scripts DTrace peuvent s’arrêter de fonctionner ou fonctionner incorrectement sans avertissement lors du changement de version de CPython.

Activer les marqueurs statiques¶

macOS est livré avec un support intégré pour DTrace. Sous Linux, pour construire CPython avec les marqueurs embarqués pour SystemTap, les outils de développement SystemTap doivent être installés.

Sur une machine Linux, cela se fait via :

$ yum install systemtap-sdt-devel

ou :

$ sudo apt-get install systemtap-sdt-dev

CPython doit être configuré avec l’option --with-dtrace :

checking for --with-dtrace... yes

Sous macOS, vous pouvez lister les sondes DTrace disponibles en exécutant un processus Python en arrière-plan et en listant toutes les sondes mises à disposition par le fournisseur Python :

$ python3.6 -q &
$ sudo dtrace -l -P python$!  # or: dtrace -l -m python3.6

   ID   PROVIDER            MODULE                          FUNCTION NAME
python18035        python3.6          _PyEval_EvalFrameDefault function-entry
python18035        python3.6             dtrace_function_entry function-entry
python18035        python3.6          _PyEval_EvalFrameDefault function-return
python18035        python3.6            dtrace_function_return function-return
python18035        python3.6                           collect gc-done
python18035        python3.6                           collect gc-start
python18035        python3.6          _PyEval_EvalFrameDefault line
python18035        python3.6                 maybe_dtrace_line line

Sous Linux, pour vérifier que les marqueurs statiques SystemTap sont présents dans le binaire compilé, il suffit de regarder s’il contient une section .note.stapsdt.

$ readelf -S ./python | grep .note.stapsdt
[30] .note.stapsdt        NOTE         0000000000000000 00308d78

Si vous avez compilé Python en tant que bibliothèque partagée (avec --enable-shared), vous devez plutôt regarder dans la bibliothèque partagée. Par exemple :

$ readelf -S libpython3.3dm.so.1.0 | grep .note.stapsdt
[29] .note.stapsdt        NOTE         0000000000000000 00365b68

Une version suffisamment moderne de readelf peut afficher les métadonnées :

$ readelf -n ./python

Displaying notes found at file offset 0x00000254 with length 0x00000020:
    Owner                 Data size          Description
    GNU                  0x00000010          NT_GNU_ABI_TAG (ABI version tag)
        OS: Linux, ABI: 2.6.32

Displaying notes found at file offset 0x00000274 with length 0x00000024:
    Owner                 Data size          Description
    GNU                  0x00000014          NT_GNU_BUILD_ID (unique build ID bitstring)
        Build ID: df924a2b08a7e89f6e11251d4602022977af2670

Displaying notes found at file offset 0x002d6c30 with length 0x00000144:
    Owner                 Data size          Description
    stapsdt              0x00000031          NT_STAPSDT (SystemTap probe descriptors)
        Provider: python
        Name: gc__start
        Location: 0x00000000004371c3, Base: 0x0000000000630ce2, Semaphore: 0x00000000008d6bf6
        Arguments: -4@%ebx
    stapsdt              0x00000030          NT_STAPSDT (SystemTap probe descriptors)
        Provider: python
        Name: gc__done
        Location: 0x00000000004374e1, Base: 0x0000000000630ce2, Semaphore: 0x00000000008d6bf8
        Arguments: -8@%rax
    stapsdt              0x00000045          NT_STAPSDT (SystemTap probe descriptors)
        Provider: python
        Name: function__entry
        Location: 0x000000000053db6c, Base: 0x0000000000630ce2, Semaphore: 0x00000000008d6be8
        Arguments: 8@%rbp 8@%r12 -4@%eax
    stapsdt              0x00000046          NT_STAPSDT (SystemTap probe descriptors)
        Provider: python
        Name: function__return
        Location: 0x000000000053dba8, Base: 0x0000000000630ce2, Semaphore: 0x00000000008d6bea
        Arguments: 8@%rbp 8@%r12 -4@%eax

Les métadonnées ci-dessus contiennent des informations pour SystemTap décrivant comment il peut mettre à jour des instructions de code machine stratégiquement placées pour activer les crochets de traçage utilisés par un script SystemTap.

Sondes DTrace statiques¶

L’exemple suivant de script DTrace montre la hiérarchie d’appel/retour d’un script Python, en ne traçant que l’invocation d’une fonction start. En d’autres termes, les appels de fonctions lors de la phase d’import ne seront pas répertoriées :

self int indent;

python$target:::function-entry
/copyinstr(arg1) == "start"/
{
        self->trace = 1;
}

python$target:::function-entry
/self->trace/
{
        printf("%d\t%*s:", timestamp, 15, probename);
        printf("%*s", self->indent, "");
        printf("%s:%s:%d\n", basename(copyinstr(arg0)), copyinstr(arg1), arg2);
        self->indent++;
}

python$target:::function-return
/self->trace/
{
        self->indent--;
        printf("%d\t%*s:", timestamp, 15, probename);
        printf("%*s", self->indent, "");
        printf("%s:%s:%d\n", basename(copyinstr(arg0)), copyinstr(arg1), arg2);
}

python$target:::function-return
/copyinstr(arg1) == "start"/
{
        self->trace = 0;
}

Il peut être utilisé de cette manière :

$ sudo dtrace -q -s call_stack.d -c "python3.6 script.py"

La sortie ressemble à ceci :

156641360502280  function-entry:call_stack.py:start:23
156641360518804  function-entry: call_stack.py:function_1:1
156641360532797  function-entry:  call_stack.py:function_3:9
156641360546807 function-return:  call_stack.py:function_3:10
156641360563367 function-return: call_stack.py:function_1:2
156641360578365  function-entry: call_stack.py:function_2:5
156641360591757  function-entry:  call_stack.py:function_1:1
156641360605556  function-entry:   call_stack.py:function_3:9
156641360617482 function-return:   call_stack.py:function_3:10
156641360629814 function-return:  call_stack.py:function_1:2
156641360642285 function-return: call_stack.py:function_2:6
156641360656770  function-entry: call_stack.py:function_3:9
156641360669707 function-return: call_stack.py:function_3:10
156641360687853  function-entry: call_stack.py:function_4:13
156641360700719 function-return: call_stack.py:function_4:14
156641360719640  function-entry: call_stack.py:function_5:18
156641360732567 function-return: call_stack.py:function_5:21
156641360747370 function-return:call_stack.py:start:28

Marqueurs statiques SystemTap¶

La façon la plus simple d’utiliser l’intégration SystemTap est d’utiliser directement les marqueurs statiques. Pour cela vous devez pointer explicitement le fichier binaire qui les contient.

Par exemple, ce script SystemTap peut être utilisé pour afficher la hiérarchie d’appel/retour d’un script Python :

probe process("python").mark("function__entry") {
     filename = user_string($arg1);
     funcname = user_string($arg2);
     lineno = $arg3;

     printf("%s => %s in %s:%d\\n",
            thread_indent(1), funcname, filename, lineno);
}

probe process("python").mark("function__return") {
    filename = user_string($arg1);
    funcname = user_string($arg2);
    lineno = $arg3;

    printf("%s <= %s in %s:%d\\n",
           thread_indent(-1), funcname, filename, lineno);
}

Il peut être utilisé de cette manière :

$ stap \
  show-call-hierarchy.stp \
  -c "./python test.py"

La sortie ressemble à ceci :

python(8274):        => __contains__ in Lib/_abcoll.py:362
python(8274):         => __getitem__ in Lib/os.py:425
python(8274):          => encode in Lib/os.py:490
python(8274):          <= encode in Lib/os.py:493
python(8274):         <= __getitem__ in Lib/os.py:426
python(8274):        <= __contains__ in Lib/_abcoll.py:366

où les colonnes sont :

temps en microsecondes depuis le début du script

nom de l’exécutable

PID du processus

et le reste indique la hiérarchie d’appel/retour lorsque le script s’exécute.

Pour une compilation –enable-shared de CPython, les marqueurs sont contenus dans la bibliothèque partagée libpython, et le chemin du module de la sonde doit le refléter. Par exemple, la ligne de l’exemple ci-dessus :

probe process("python").mark("function__entry") {

doit plutôt se lire comme :

probe process("python").library("libpython3.6dm.so.1.0").mark("function__entry") {

(en supposant une version compilée avec le débogage activé de CPython 3.6)

Marqueurs statiques disponibles¶

function__entry(str filename, str funcname, int lineno)¶

Ce marqueur indique que l’exécution d’une fonction Python a commencé. Il n’est déclenché que pour les fonctions en Python pur (code intermédiaire).

Le nom de fichier, le nom de la fonction et le numéro de ligne sont renvoyés au script de traçage sous forme d’arguments positionnels, auxquels il faut accéder en utilisant $arg1, $arg2, $arg3 :

$arg1 : (const char *) nom de fichier, accessible via user_string($arg1)

$arg2 : (const char *) nom de la fonction, accessible via user_string($arg2)

$arg3 : numéro de ligne int

function__return(str filename, str funcname, int lineno)¶

Ce marqueur est l’inverse de function__entry(), et indique que l’exécution d’une fonction Python est terminée (soit via return, soit via une exception). Il n’est déclenché que pour les fonctions en Python pur (code intermédiaire).

Les arguments sont les mêmes que pour function__entry()

line(str filename, str funcname, int lineno)¶

Ce marqueur indique qu’une ligne Python est sur le point d’être exécutée. C’est l’équivalent du traçage ligne par ligne avec un profileur Python. Il n’est pas déclenché dans les fonctions C.

Les arguments sont les mêmes que pour function__entry().

gc__start(int generation)¶: Fonction appelée lorsque l’interpréteur Python lance un cycle de collecte du ramasse-miettes. arg0 est la génération à scanner, comme gc.collect().

gc__done(long collected)¶: Fonction appelée lorsque l’interpréteur Python termine un cycle de collecte du ramasse-miettes. Arg0 est le nombre d’objets collectés.

Tapsets de SystemTap¶

La façon la plus simple d’utiliser l’intégration SystemTap est d’utiliser un « tapset ». L’équivalent pour SystemTap d’une bibliothèque, qui permet de masquer les détails de niveau inférieur des marqueurs statiques.

Voici un fichier tapset, basé sur une version non partagée compilée de CPython :

/*
   Provide a higher-level wrapping around the function__entry and
   function__return markers:
 \*/
probe python.function.entry = process("python").mark("function__entry")
{
    filename = user_string($arg1);
    funcname = user_string($arg2);
    lineno = $arg3;
    frameptr = $arg4
}
probe python.function.return = process("python").mark("function__return")
{
    filename = user_string($arg1);
    funcname = user_string($arg2);
    lineno = $arg3;
    frameptr = $arg4
}

Si ce fichier est installé dans le répertoire tapset de SystemTap (par exemple /usr/share/systemtap/tapset), alors ces sondes supplémentaires deviennent disponibles :

python.function.entry(str filename, str funcname, int lineno, frameptr)¶: This probe point indicates that execution of a Python function has begun. It is only triggered for pure-python (bytecode) functions.

python.function.return(str filename, str funcname, int lineno, frameptr)¶: This probe point is the converse of python.function.return(), and indicates that execution of a Python function has ended (either via return, or via an exception). It is only triggered for pure-python (bytecode) functions.

Exemples¶

Ce script SystemTap utilise le tapset ci-dessus pour implémenter plus proprement l’exemple précédent de traçage de la hiérarchie des appels de fonctions Python, sans avoir besoin de nommer directement les marqueurs statiques :

probe python.function.entry
{
  printf("%s => %s in %s:%d\n",
         thread_indent(1), funcname, filename, lineno);
}

probe python.function.return
{
  printf("%s <= %s in %s:%d\n",
         thread_indent(-1), funcname, filename, lineno);
}

Le script suivant utilise le tapset ci-dessus pour fournir une vue de l’ensemble du code CPython en cours d’exécution, montrant les 20 cadres de la pile d’appel (stack frames) les plus fréquemment utilisées du code intermédiaire, chaque seconde, sur l’ensemble du système :

global fn_calls;

probe python.function.entry
{
    fn_calls[pid(), filename, funcname, lineno] += 1;
}

probe timer.ms(1000) {
    printf("\033[2J\033[1;1H") /* clear screen \*/
    printf("%6s %80s %6s %30s %6s\n",
           "PID", "FILENAME", "LINE", "FUNCTION", "CALLS")
    foreach ([pid, filename, funcname, lineno] in fn_calls- limit 20) {
        printf("%6d %80s %6d %30s %6d\n",
            pid, filename, lineno, funcname,
            fn_calls[pid, filename, funcname, lineno]);
    }
    delete fn_calls;
}

Instrumenter CPython avec DTrace et SystemTap¶

Activer les marqueurs statiques¶

Sondes DTrace statiques¶

Marqueurs statiques SystemTap¶

Marqueurs statiques disponibles¶

Tapsets de SystemTap¶

Exemples¶

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